陈崇教授长期研究成体干细胞的自我更新和衰老及肿瘤发生发展的分子机制和靶向治疗。近年来利用RNA干扰、CRISPR/Cas9基因组编辑、小鼠基因工程等技术研究肿瘤相关变异，特别是表观遗传学相关基因和染色体异常在肿瘤发生发展中的作用。目前已在国际学术期刊Nature（IF=41.5）、Cancer Cell （IF=23.9）、Genes Development (IF=12.6)、Journal of Experimental Medicine (IF=15.2)、Journal of Clinical Investigation (IF=15.4) 等发表论文20余篇，他引近2000次。主持多项国家自然科学基金面上及秀青年基金项目及国家重点研发计划“蛋白质机器与生命过程调控”重点专项子课题。获得了包括白血病与淋巴癌协会“职业发展奖（2011-2014，the Leukemia & Lymphoma Society Career Development Program Award）、Keystone 研讨会“未来科学奖学金”（Keystone Symposia Future of Science Fund Scholarship 2014)等多个学术奖项。