马俊亚，男，1966年生，江苏沭阳人。1996年获得历史学博士学位，1998年历史学博士后出站。1998年担任南京大学副教授，2006年被聘为教授、博导。
南京大学登峰计划人才、南京大学优秀中青年学科带头人（A类）以及南京大学重点学科专门史（区域史）带头人、抗日战争协同创新中心任首席教授。曾任台湾政治大学客座教授、安徽大学特聘教授、聊城大学兼职教授、云南大学西南环境研究所学术顾问等。
2000-2001年在美国伊利诺依大学访学一年；2006-2007年，在澳大利亚LA TROBE大学合作研究；2007年在台湾大学合作研究；2011-2012年，在台湾政治大学为本科生、研究生开设“中国近代社会生活史”和“中国社会生态史”课程。赴美国、日本、德国等参加国际会议约有10余次。与美国Occidental College(西方学院)建立了共同培养学者、通过远程电视共同开设生态课程、互派学生访学等联系。