先后主持国家杰出青年基金、重点基金和中科院战略先导B项目等，在Science、NSR、Water Research、ES&T、Ecology、Journal of Ecology等SCI期刊上发表论文300余篇，截至2021年3月，SCI他引8200余次，H指数=49，CNKI他引7500余次。获著名国际奖—生态学琵琶湖奖，连续6年入选Elsevier Scopus生态环境领域中国高被引学者榜单。

谢平注重理论与实践相结合，围绕水华蓝藻的生态学、毒理学与生物控制等取得了系统性、创新性和开拓性的研究成就，产生了重要的社会效应和国际影响：①提出了控制水华的非经典生物操纵学说，获得高度评价与广泛应用；②将稳态转化的创新性成果成功应用于水生植被修复与重建工程（成都、重庆等地）；③揭示了微囊藻毒素（MC）对人类慢性健康效应的证据，是MC研究历史上重要进展之一，40多篇论文被世界卫生组织（WHO）、欧洲食品安全局、美国环境总署和加拿大卫生部以及十多个欧美地方政府列为制定MC控制标准的技术支撑文献。谢平是应邀参与世界卫生组织新版《水中有毒蓝藻，其公共卫生后果、监测和管理指南》（2021）技术审定的唯一中国专家。先后出版专著9部，曾任国务院学位委员会学科评议组成员，培养了100多名硕/博士，20多名已晋升教授。现任国家水专项湖泊主题专家组成员、洱海抢救性保护专家组组长、千岛湖生态环境保护专家等，其成果正在为湖泊治理与生态修复、国家水生态安全保护发挥重要作用。