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本研究组围绕RNA结合蛋白和非编码RNA,主要关注RNA-蛋白质复合物在转录和表观遗传层面如何调控基因表达,以及如何在细胞分化、转分化和癌症发生等命运决定过程中发挥作用。主要研究内容包括:
一、非编码RNA的功能机制研究
人类基因组的广泛转录产生了海量的非编码RNA,它们虽然也携带遗传信息,但是往往不具备蛋白质编码潜能,其调控功能主要通过形成复杂的高级结构并与其它RNA分子相互作用而实现。我们重点关注增强子RNA(enhancer RNA, eRNA)、启动子RNA(promoter upstream antisense RNA, uaRNA)和长链非编码RNA(long noncoding RNA),期望通过利用各种RNA功能基因组学手段,系统研究这些非编码RNA的功能机制及其实现的结构基础。
二、RNA结合蛋白的转录调控机制
RNA结合蛋白可在转录和转录后水平调控基因表达。非编码RNA往往需要与RNA结合蛋白形成复合物以调控转录,因此研究RNA与蛋白质的相互作用位点和模式是探索非编码RNA功能机制的关键,也是我们课题组的重点关注方向。
三、RNA互作组学新技术开发
RNA在体内以高级结构形式存在,RNA结构的动态变化对于遗传信息的精确传递至关重要。目前,RNA的原位高级结构和作用靶标研究依然是领域内的瓶颈难题。我们将开发RNA空间互作组学新技术和计算新体系,以解决这些难题。此外,研究RNA结合蛋白的经典CLIP-seq方法需要大量的细胞,无法解决细胞的异质性和个别细胞数目稀缺的问题,因此亟待开发单细胞的功能基因组学研究方法。
一、非编码RNA的功能机制研究
人类基因组的广泛转录产生了海量的非编码RNA,它们虽然也携带遗传信息,但是往往不具备蛋白质编码潜能,其调控功能主要通过形成复杂的高级结构并与其它RNA分子相互作用而实现。我们重点关注增强子RNA(enhancer RNA, eRNA)、启动子RNA(promoter upstream antisense RNA, uaRNA)和长链非编码RNA(long noncoding RNA),期望通过利用各种RNA功能基因组学手段,系统研究这些非编码RNA的功能机制及其实现的结构基础。
二、RNA结合蛋白的转录调控机制
RNA结合蛋白可在转录和转录后水平调控基因表达。非编码RNA往往需要与RNA结合蛋白形成复合物以调控转录,因此研究RNA与蛋白质的相互作用位点和模式是探索非编码RNA功能机制的关键,也是我们课题组的重点关注方向。
三、RNA互作组学新技术开发
RNA在体内以高级结构形式存在,RNA结构的动态变化对于遗传信息的精确传递至关重要。目前,RNA的原位高级结构和作用靶标研究依然是领域内的瓶颈难题。我们将开发RNA空间互作组学新技术和计算新体系,以解决这些难题。此外,研究RNA结合蛋白的经典CLIP-seq方法需要大量的细胞,无法解决细胞的异质性和个别细胞数目稀缺的问题,因此亟待开发单细胞的功能基因组学研究方法。
研究兴趣
论文共 84 篇作者统计合作学者相似作者
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期刊级别
合作者
合作机构
Fundamental Researchno. 5 (2023): 655-656
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Fundamental Researchno. 5 (2023): 655-656
引用0浏览0引用
0
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Science Bulletinno. 13 (2023): 1399-1412
RNA technologiespp.41-71, (2023)
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