韶关市2006年B型流感病毒流行与HA1基因变异分析

Journal of Tropical Medicine(2010)

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摘要
目的 了解2006年韶关市B型流感病毒的流行及基因变异情况.方法 收集2006年韶关市流感监测及疫情资料,并随机选取流感疫情中分离的1株B型毒株,提取病毒RNA,RT-PCR扩增病毒HA1基因,纯化产物进行核苷酸序列测定.使用DNA Start MeggAlign等生物软件包进行序列分析.结果 2006年流感监测与疫情中共分离到22株B型流感毒株,分离率为2.48%(22/887),发生的35起流感疫情中有9起检出B型流感病毒.爆发时间多集中在3-4月;B/SG/y139/2006与B型代表株B/HongKong/330/2001相比,同源性为96.3%.其中有7个氨基酸替换发生在抗原决定蔟,在第197位增加了1个糖基化位点.2005和2006年分离的两毒株之间有2个氨基酸发生了替换.结论 韶关市整体人群的B型Victoria系抗体水平比较低,2006年分离的B型流感毒株与B/HongKong/330/2001相比基因特性发生了变异,是2006年B型Victoria系流感病毒在韶关市成为优势毒株的原因.
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关键词
gene mutation,influenza b virus,epidemic,epitopes,outbreaks,epidemiology,genes,amino acids
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