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SVILUPPO DI UNA PCR QUANTITATIVA COMPETITIVA PER LA DETERMONAZIONE DELLA CARICA VIRALE DEL CITOMEGALOVIRUS E CONFRONTO CON L’ANTIGENEMIA, LA VIREMIA E IL NASBA

Microbiologia medica(2006)

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摘要
Introduzione.Abbiamo valutato le prestazioni del nuovo dosaggio Abbott Real-Time HIV-1 RNA quantitativo basato su estrazione automatica e chimica non esonucleasica (strand-displacement probe).Questo formato dovrebbe garantire robustezza nei confronti di eventuali "mismatches" presenti nella regione di ibridizzazione del probe.Il range dinamico del test (protocollo con volume iniziale di 1 mL) è compreso tra 40 e 10 7 copie/mL.Lo studio è stato eseguito con volume inizale di 0,5 mL (sensibilità 75 copie/mL).Metodi.Sono stati analizzati 79 campioni retrospettivi da 60 pazienti con infezione da HIV, il cui monitoraggio della carica virale era stato effettuato con il test b-DNA v.3 (Bayer).Risultati.Considerando il limite di sensibilità di 75 e 50 copie per Abbott e b-DNA rispettivamente, la concordanza qualitativa dei dosaggi era pari al 93,7% (74/79) con 3 risultati Abbott positivi/b-DNA negativi (range 80-154 copie/mL) e 2 bDNA postitivi/Abbott negativi (277 e 811 copie/mL).Vi erano inoltre 3 campioni con risultato Abbott <75 copie/mL ma con target rilevato, che erano <50 copie/mL con b-DNA.Per i 59 campioni quantificabili con entrambi i metodi, la retta di regressione lineare tra i valori Abbott (y) e b-DNA (x) aveva equazione y = 0,921x +0,573 (r= 0,882).Il 71% e il 93% dei campioni mostrava una differenza compresa entro 0,5 ed 1,0 log rispettivamente, con una differenza media Abbott-bDNA di 0,27 log (DS=0,48log).Analizzando separatemente i campioni in base alla provenienza geografica, differenza media e coefficiente di correlazione r erano 0,12 log/0,834 per i soggetti di nazionalità italiana e di 0,41 log/0,967 per quelli non italiani (in prevalenza africani).
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