2011-15-3等4个茶树新品系亲缘关系的?EST-SSR分析?

Journal of Food Safety and Quality(2015)

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摘要
目的:对2011-15-3等4个茶树新品系进行亲缘关系分析,以期为新品系的识别、新品种登记及育种亲本选配提供可靠依据。方法利用文献开发的24对EST-SSR引物,对4个茶树新品系等7份材料进行PCR扩增,在所得相似系数的基础上进行UPGMA聚类,并绘制亲缘关系树状聚类图。结果24对引物共扩增出69个等位位点,平均2.88;平均杂合度观测值(Ho)、平均杂合度期望值(He)、Shannon指数的平均值分别为0.42、0.54、0.75,相似系数变幅为0.47~0.89。槠叶齐、碧香早、高芽齐的后代与其母本相似系数值分别高达0.84、0.79、0.79、0.78。根据相似系数矩阵按UPGMA法进行聚类,在相似系数平均值0.66处可将参试的7份材料分为3类:第Ⅰ类为高芽齐和2011-34-1,第Ⅱ类为槠叶齐、2011-21-1和2011-21-3,第Ⅲ类为碧香早和2011-15-3。结论明确了4个茶树新品系与其他品种的亲缘关系及品种间的遗传距离。
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关键词
genetic markers,alleles,tea,expressed sequence tags,genetic diversity,heterozygosity,simple sequence repeats,phylogenetics
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