Profil épidémiologique et bactériologique des infections intra-abdominales

Introduction Les infections intra-abdominales figurent parmi les principaux defis de la chirurgie generale puisqu’elles peuvent se compliquer de septicemie et de choc septique. Compte tenu de leur frequence et de leur gravite, nous avons mene ce travail afin d’etudier les profils bacteriologique et epidemiologique de ces infections. Materiels et methodes Dans cette etude retrospective, ont ete inclus, tous les prelevements intra abdominaux parvenus au laboratoire de microbiologie sur une periode d’une annee (decembre 2017 a novembre 2018). L’identification des souches bacteriennes isolees a ete faite sur l’automate Vitek2 ou moyennant les micro-galeries d’identification. L’etude et l’interpretation de la sensibilite aux antibiotiques a ete faite selon les recommandations du comite de l’antibiogramme de la societe francaise de microbiologie (CA-SFM). Resultats Au total, 166 prelevements ont ete inclus dans cette etude, parmi lesquels 55,4 % (n = 92) etaient poly microbiens. Les patients correspondants etaient majoritairement de sexe masculin (n = 90 ; 54,2 %) avec une moyenne d’âge de 47 ans (6–98 ans). Un terrain d’immunodepression a ete retrouve dans 18,6 % (n = 31) des cas. Les diagnostics les plus frequemment retrouves etaient : les peritonites (n = 50 ; 30,1 %), dont 52 % (n = 26) etaient des peritonites post-operatoires, les infections biliaires (n = 36 ; 21,6 %) et les abces appendiculaires (n = 34 ; 20,4 %). Les bacilles a Gram negatif (BGN) aerobies etaient isoles dans 56,5 % (n = 168) des cas avec une nette predominance des enterobacteries. Parmi les cocci a Gram positif, les enterocoques etaient isoles dans 8,7 % (n = 26) des cas. Les bacilles a Gram negatif anaerobies ont ete isoles dans 20,5 % (n = 61) des cas. Leurs taux de resistance a l’amoxicilline et a l’association amoxicilline-acide clavulanique etaient respectivement de 73,7 % (n = 45) et de 3,2 % (n = 2). Toutes les souches de BGN anaerobies etaient sensibles au metronidazole. Vingt-sept bacteries multiresistantes et deux bacteries hautement resistantes emergentes (BHRe) correspondant a une souche d’enterobacterie productrice de carbapenemase et une souche d’Enterococcus faecium resistante a la vancomycine ont ete isolees. Treize souches (4,3 %) appartenant au genre Candida ont ete retrouvees dont une seule etait resistante au fluconazole mais sensible aux echinocandines. Conclusion Une meilleure connaissance de l’epidemiologie et des profils de resistance des germes les plus incrimines dans les infections intra-abdominales s’avere utile pour optimiser le choix de l’antibiotherapie probabiliste.