藻蓝色素蛋白抑制A549细胞活性机制的miRNA转录组学分析

藻蓝色素蛋白是我国认可的天然食用色素,可用于多种低温食品的着色;它同时也是一种优良的功能性色素蛋白.许多研究表明,藻蓝蛋白具有显著的肿瘤抑制作用,能够抑制非小细胞肺癌的增殖和迁移.为深入探究藻蓝蛋白抑制非小细胞肺癌活性的调控机制,本研究以A549细胞为代表,采用高通量小分子RNA转录组测序技术对藻蓝蛋白处理前后的细胞进行miRNA的筛选分析.结果表明,已知和新预测的miRNA被成功测序;通过统计学分析筛选得到了136个藻蓝蛋白处理后具有表达差异的miRNA,其中74个显著上调,62个显著下调.根据这些差异miRNA在不同样本中的表达情况,可以聚类为4类不同的表达模式;实时荧光定量聚合酶链式反应对上述miRNA进行表达量的验证,与转录组测序结果相吻合;此外,miRNA靶基因的Gene Ontology注释和功能富集分析结果显示,与细胞增殖信号转导调控过程相关的靶蛋白例如PAK4、MAPK13、RASSF10等均被预测为差异miRNA的全新靶点,可能在藻蓝蛋白抑制非小细胞肺癌增殖过程中起到重要的调控作用.不同于传统的mRNA转录组测序,本研究采用小分子miRNA测序深入探究了藻蓝蛋白抑制肺癌细胞生长的调控机制,为抗肿瘤类功能食品因子的利用提供了理论依据,同时为非小细胞肺癌的靶向治疗提供了重要的理论参考.