沙拐枣甜菜碱醛脱氢酶基因的克隆与生物信息学分析

[目的]揭示抗逆植物沙拐枣甜菜碱醛脱氢酶(CmBADH)的基因序列.[方法]利用RACE技术克隆CmBADH基因的全长序列,并对其基因序列和蛋白序列进行生物信息学分析.[结果]CmBADH基因的cDNA全长1863 bp,开放阅读框(ORF)全长1506 bp,编码501个氨基酸.通过Blastn比对,发现CmBADH与海马齿(Sesuvium portulacastrum)、山谷栎(Quercus lobata)、盐爪爪(Kalidium foliatum)的BADH相似性分别达到80.04％、79.97％、79.55％.其相对分子量为123.46 kDa,等电点(pI)5.01,蛋白序列共有16个磷酸化位点;不含有跨膜结构域;不含有信号肽位点;含有一个甜菜碱醛脱氢酶结构域(PLN02467).二级结构显示α螺旋占43.31％,无规则卷曲占31.94％,延伸链占17.37％,β转角占7.38％.三级结构模型为椭球形.[结论]沙拐枣CmBADH基因序列的确定,为今后研究沙拐枣CmBADH基因的抗逆功能提供研究基础.