蛙皮素样肽家族及其受体氨基酸序列信息学比较分析

[目的]研究反刍动物蛙皮素样肽家族多肽及其受体的保守性.为不同动物,特别是反刍动物这2种蛙皮素样多肽及其受体蛋白抗原设计和活性多肽筛选等研究提供参考.[方法]采用生物信息分析学的方法,通过UniProt数据库比较牛的蛙皮素样肽家族胃泌素释放肽(Gastrin-releasing peptide,GRP)和神经介素B(Neuromedin B,NMB)2种多肽及其特异性受体GRP-R和NMB-R与其他动物氨基酸序列的差异性.[结果]13种动物成熟GRP多肽C-端的8个氨基酸序列完全相同,牛GRP氨基酸序列与绵羊、猪和豚鼠最高,分别为88.7％、77.8％和77.8％,与其他动物相似性低于74.1％.10种动物成熟NMB多肽C-端10个氨基酸序列完全相同.牛GRP-R与狗、马和猪等相似性最高,分别为96.1％、94.3％和94.0％,牛NMB-R与猪、人和马相似性最高,分别为92.3％、91.5％和91.0％;牛GRP-R与NMB-R相似性仅为62.2％.[结论]GRP和NMB的C-端氨基酸序列在不同动物之间均具有高度的保守性,而N-端为变化区域,且GRP-R和NMB-R氨基酸序列在动物之间保守性较高.