双斑东方鲀循环水养殖水体细菌群落结构分析

Journal of Fisheries Research(2018)

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摘要
利用16S rRNA高通量基因测序技术研究了双斑东方鲀(Fugu bimaculatus)循环水养殖系统养殖水体细菌种群结构特征,并比较养殖患病(溃疡症)的双斑东方鲀的水体细菌群落结构与健康的之间的差异,探讨细菌群落结构与双斑东方鲀细菌性病害发生的相关性.研究结果表明,双斑东方鲀循环水养殖水体细菌群落的优势细菌门为变形菌门(Proteobacte-ria)、 拟杆菌门(Bacteroidetes),优势细菌纲为γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)、 黄杆菌纲(Flavobacteriia)、 α-变形菌纲(Alphaproteobacteria),优势细菌目为黄杆菌目(Fla-vobacteriales)、 硫发菌目(Thiotrichales)、 红细菌目(Rhodobacterales)、 交替单胞菌目(Al-teromonadales)、 弧菌目(Vibrionales),优势细菌科为黄杆菌科(Flavobacteriaceae)、 硫发菌科(Thiotrichaceae)、 红细菌科(Rhodobacteraceae)、 弧菌科(Vibrionaceae)、 交替假单胞菌科(Pseudoalteromonadaceae).患病的和健康的循环水养殖水体细菌群落种类组成相似度高,细菌群落多样性指数无较大差异,在同一分类水平上各细菌群落丰度占比差异显著;二者核心微生物(属)的差异明显,健康的循环水养殖水体核心细菌群落以Polaribacter属为主;患病的循环水养殖水体核心细菌群落以弧菌科的发光杆菌属(Photobacterium)和弧菌属(Vibrio)为主,而发光杆菌属和弧菌属的多数种类属于病原菌或条件致病菌.双斑东方鲀患病(溃疡症)与养殖水体细菌群落的弧菌属丰度占比高有关.该研究结果对双斑东方鲀循环水养殖细菌性病害的监测、 预警、 诊断及管理控制具有重要的意义.
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