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肉鸡肺动脉组织中MEOX2基因克隆与生物信息学分析

Chinese Journal of Veterinary Science(2020)

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摘要
克隆构建肉鸡间充质同源盒蛋白2 (mesenchyme homeobox,MEOX2)重组质粒pUCm-T-MEOX2,并对其进行生物信息学分析.通过提取肉鸡肺动脉组织基因组RNA,并反转录为cDNA,利用PCR方法扩增MEOX2基因片段,并将目的片段通过TA克隆到pUCm-T载体上获得重组质粒,测序后对其进行生物信息学分析.结果 显示,成功获得pUCm-T-MEOX2重组质粒,目的基因片段为819 bp,可编码273个氨基酸,其序列同源性与原鸡无差异;其存在45个磷酸化位点和1个N-糖基化修饰位点;经预测MEOX2蛋白亚细胞定位于细胞核,无信号肽;MEOX2蛋白为亲水性蛋白且无跨膜结构;二级结构预测为α-螺旋、延伸链、β-转角和无规卷曲,分别占22.79%,9.93%,3.68%,63.60%;三级结构主要由无规卷曲和α-螺旋组成;其有11个B细胞抗原表位.本试验结果可为MEOX2基因抗体制备奠定良好的基础,进而为肉鸡腹水综合征的肺动脉血管重构病理检测及基因药物治疗提供有力的依据.
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