隆林黑猪氨肽酶N基因的生物信息学分析和原核表达

本研究旨在进行猪氨肽酶N (porcine aminopeptidase N,pAPN)基因扩增和生物信息学分析,并在大肠杆菌中进行表达.从三元杂商品猪和广西地方猪隆林黑猪中扩增出pAPN基因,通过ExPASy和Mega 6.0等软件对其进行生物信息学和系统进化分析;将pAPN克隆到原核表达载体pET-32a(+),构建重组质粒pET-32a-pAPN,使其在大肠杆菌Rosetta(DE3)感受态细胞中表达.经IPTG诱导表达、纯化,产物用SDS-PAGE和Western blotting进行分析.结果 显示,隆林黑猪和三元杂商品猪的pAPN基因长2 949 bp,开放性阅读框为2 892 bp,编码963个氨基酸,同源性为100％,与GenBank数据库中公布的标准序列(登录号:NM_214277)相比,隆林黑猪共有5处氨基酸突变,其中Phe82Asn、Leu107Phe、Leu108Ile和Ser330Pr0 4处突变位于pAPN酶催化活性区域,Va1621Ile突变位于APN病毒结合区域.pAPN为不稳定的亲水性蛋白,跨膜区位于第17～33位氨基酸,有1 2个N-糖基化位点,33个B细胞抗原表位预测位点,三级结构为同源二聚体.Val621Ile突变可能影响APN结合病毒的能力.试验成功构建重组质粒pET-32a-pAPN,SDS-PAGE鉴定以包涵体形式表达,纯化后的蛋白在123 ku处有明显条带,且具有良好的抗原性,为进一步获得多克隆抗体、研究该基因和TGEV、PEDV、PDCoV的关系奠定基础.