青狗尾草(Setaria viridis)SBP基因家族的鉴定及表达分析

SQUAMOSA启动子结合蛋白家族作为一种转录调控因子广泛存在于植物中,起着调节生长发育及多种生理生化反应.目前,其编码基因已从多种植物中分离鉴定,但是在作为单子叶C4模式生物的青狗尾草中却尚未研究.本研究基于生物信息学方法,从青狗尾草全基因组中鉴定出17个SBP基因,对这些基因的结构、理化性质、染色体定位以及共线性进行分析,并且探讨了这些基因在不同组织的表达情况,此外,还对SBP蛋白质的基序和系统进化进行了分析.结果 表明17个SBP基因分布于9条染色体上,其中SvSBP1与SvSBP9、SvSBP3和SvSBP12、SvSBP4和SvSBP14具有线性同源性,共有11个基因包含miR156结合位点.这些基因编码的SBP蛋白表现出不同物种的某些SBP蛋白之间较同一物种的SBP蛋白的遗传关系更近,暗示这些SBP家族成员的基本特征早在单双子叶植物分化之前就已经形成.SvSBP2、SvSBP8、SvSBP13、SvSBP17在所有组织中都有表达,SvSBP15、SvSBP16在所有组织中都不表达外,其余基因均在不同组织中特异性表达,其中花序分生组织中表达的基因数最多,暗示这些基因可能在青狗尾草花的形成中扮演重要角色,并与胁迫响应和叶片的生长发育相关.本研究为进一步鉴定基因功能、阐明青狗尾草生长发育的分子机理提供基础性信息.