CIP2A在不同肝病组织中表达及其协同表达基因的生物信息学分析

目的 分析蛋白磷酸酶的癌性抑制因子(CIP2A)在不同肝病组织中表达,探索CIP2A协同表达基因网络中的潜在干预靶点.方法 采用组织芯片免疫组织化学染色明确CIP2A在不同肝病组织中的表达,应用权重基因共表达网络分析(WGCNA),探索CIP2A基因同肝细胞癌差异表达基因的基因模块之间的关系,在DAVID数据库中进行相关功能富集分析及信号转导通路富集分析.结果 组织芯片上60例肝细胞癌组织标本中,49例肝癌组织中CIP2A蛋白表达阳性或强阳性,阳性率为81.67％,7例肝硬化组织标本中有2例间质纤维明显增生的肝组织,可见CIP2A蛋白在肝细胞胞浆中存在弱阳性表达,阳性率为28.56％,而5例正常肝脏组织 、8例慢性活动性肝炎组织标本中均未见CIP2A蛋白阳性表达.肝癌组织中CIP2A阳性率表达率明显高于肝硬化组织 、慢性活动性肝炎组织及正常肝组织,差异有统计学意义(P<0.05).CIP2A在晚期肝癌(Ⅲ ～ Ⅳ 级)阳性表达率为88.89％(16/18),在早中期(Ⅰ ～ Ⅱ 级)阳性表达率为42.86％(18/42),晚期肝癌组织中CIP2A阳性率表达率明显高于早中期肝癌组织,差异有统计学意义(P=0.05).权重基因共表达网络分析(WGCNA)结果显示,CIP2A与MEturquoise模块中其他438个基因密切相关,通过计算两两之间的Pearson相关系数,在36种相关性最显著的基因中,CIP2A与其他大部分基因(31/35,88.6％)的相关系数>0.4.KEGG通路富集分析结果提示,与CIP2A密切相关基因集中在3条信号通路,包括细胞周期 、DNA复制及p53信号通路.GO生物学功能通路富集分析显示,与CIP2A密切相关基因主要集中在15种生物学功能通路,包括细胞分裂 、核有丝分裂 、DNA复制等.结论 CIP2A与肝癌的发生发展密切相关,涉及多个生物学过程和信号转导通路.