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实时荧光PCR用于CYP2C19基因多态性检测的性能验证

Laboratory Medicine(2017)

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摘要
目的 评价实时荧光聚合酶链反应(PCR)检测细胞色素P450家族成员2C19(CYP2C19)基因多态性的精密度、准确度和检测限.方法 采用实时荧光PCR对基因型为*1/*1、*1/*2、*1/*3和*1/*17的DNA样本分别作批内重复扩增10次,以评价方法的精密度;比较实时荧光PCR与Sanger测序法的检测结果,以评价方法的准确性;对2倍梯度稀释的DNA样本(基因型为*1/*1、*1/*2、*1/*3和*1/*17)进行实时荧光PCR扩增,以评价方法的最低检测限.结果 批内重复10次的分型检测结果完全一致,所有PCR的Ct值变异系数(CV)均<2.5%;实时荧光PCR的分型结果与Sanger测序法结果的符合率为100%(20/20),其中*1/*17型1例、*1/*1型3例、*1/*2型5例、*1/*3型5例、*2/*2型4例、*2/*3型2例;实时荧光PCR的最低检测限为1.875 ng/μL DNA.结论 实时荧光PCR的基因分型结果稳定、可靠,适用于医学实验室CYP2C19基因多态性的检测.
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关键词
Cytochrome P4502C19,Gene polymorphism,Drug-metabolizing enzyme,Real-time fluorescence polymerase chain reaction,Proficiency testing
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