一株引起病毒性脑炎的柯萨奇B组5型病毒全基因组分析

目的 对一株病毒性脑炎病原柯萨奇病毒B5 (coxsackievirus B5,CV B5)分离株KMA2/YN/CHN/2010的全基因组及其遗传特性进行分析.方法 对297份病毒性脑炎患者脑脊液在RD细胞进行病毒分离;提取病毒RNA,采用RT-PCR移步法分段扩增CV-B5全长基因,经测序和拼接后,利用MEGA7.0和SimPlot 3.5.1等软件进行分析.结果 通过分离获得一株阳性分离株,经鉴定为CV-B5 KMA2/YN/CHN/2010株,其基因组全长为7 395 bp,编码含2 185个氨基酸残基的多聚蛋白.与其他CV B5病毒分离株的全基因组的核苷酸和氨基酸同源性分别为79.6％～98.8％和93.1％～98.1％;KMA2/YN/CHN/2010与其他CV-B5株在各区段核苷酸和氨基酸同源性分别为75.0％ ～ 100.0％和88.8％～ 100.0％.其中与A210/KM/09株同源性最高.进化分析发现CV B5分4个基因型,KMA2/YN/CHN/2010属于C基因型.通过重组分析发现KMA2/YN/CHN/2010可能为重组株.结论 KMA2/YN/CHN/2010与其他中国株一样同属于C基因型.