高通量基因芯片在口岸疟原虫检测中的应用

目的 验证及应用一种同时快速检测4种疟原虫的高通量基因芯片方法. 方法 收集上海口岸现场经显微镜镜检及荧光PCR确认后的间日疟、恶性疟、三日疟、卵形疟病例血样,采用高通量基因芯片对4份疟原虫阳性血样同时进行验证检测.提取4种疟原虫DNA,采用实时荧光定量PCR进行定量,使用芯片检测经梯度稀释的疟原虫DNA样品,评价芯片的灵敏度.将4种疟原虫DNA和相同数量级浓度的诺氏疟原虫、微小隐孢子虫、结肠小袋纤毛虫DNA进行交叉反应检测,评价芯片的特异性.采集50例云南现场疑似疟疾病例血样,采用芯片进行检测,并与镜检结果进行比较. 结果 芯片检测上海口岸4份疟原虫阳性血样的结果与镜检和PCR结果相符,检测过程仅需2h.芯片灵敏度检测结果显示,其对疟原虫DNA的检测下限分别为间日疟原虫78 copies/μl、三日疟原虫87 copies/μl、恶性疟原虫135 copies/μl、卵形疟原虫302 copies/μl.芯片特异性检测结果显示,4种疟原虫均可检出,诺氏疟原虫、微小隐孢子虫、结肠小袋纤毛虫均未检出,无交叉反应.云南现场采集的50份疑似疟疾病例血样芯片检测结果显示,间日疟原虫阳性18份、恶性疟原虫阳性12份、三日疟原虫阳性1份,与镜检结果相符. 结论 该高通量基因芯片可以同时检测4种疟原虫,具有快速、准确、灵敏度高的特点,适合现场筛检及疟疾疫情防控的需要.