2015年盐城市甲型H3N2亚型流感病毒HA1基因分子进化特征分析

Jiangsu Journal of Preventive Medicine(2017)

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摘要
目的 了解盐城市2015年甲型H3N2流感病毒分离株表面血凝素HA1基因分子进化特征.方法 对哨点医院流感样病例标本进行核酸检测、病毒分离;选取甲型H3N2毒株,采用一步法RT-PCR扩增其HA1区,并进行序列分析,采用DNAStar软件包中MegAlign进行核苷酸及氨基酸同源性分析,以MEGA6.0软件进行序列比对及基因种系进化特征分析.结果 2015年盐城市流感样病例(ILI)监测样本中流感病毒核酸阳性率为8.36%,乙型、甲型H3N2、新甲H1N1型交替流行.抽取的7株甲型H3N2分离株,其HA1基因核苷酸同源性为98.7%~100.0%,氨基酸同源性为97.9%~100.0%;其HA1区氨基酸位点变异呈散在性分布,均未发生氨基酸的丢失和插入,氨基酸突变主要位于抗原决定簇的A、B和C区.除A/JSYC/11025/2015外,其余6株新增2个糖基化位点,其中158 aa位点位于抗原决定簇B区.结论 2015年盐城市流感流行以甲型H3N2和乙型Yamagata系为主,具有典型的冬、夏双高峰特点.病毒HA1区基因特性逐渐发生变异,可能导致抗原变化,应进一步加强流感病原学监测.
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