引发脑膜脑炎流行的柯萨奇B5病毒的序列分析

安徽省明光市2001年6～7月发生了一起无菌性脑膜脑炎流行,从病人脑脊液和粪便标本中分离到17株柯萨奇(Coxsackie,Cox.)B5病毒,血清学实验证明所分离的病毒为此次无菌性脑膜脑炎流行的病因.对其中的2株病毒(MG/18/2001和MG/39/2001)测定了VP1区全基因核酸序列并做了比较分析.结果显示:所测2株病毒VP1区核苷酸长度均为849bp,两毒株之间仅有1个核苷酸不同.这两株病毒与从(GenBank)检索到的Cox.B5病毒的核苷酸同源性约为82%,氨基酸序列亦有改变.从进化树上看,这两株病毒同在一个小分支上,与它们亲缘关系最近的是从一疑似脊髓灰质炎的儿童分离到的AF114383-Cox.B5病毒,而与从手足口病患者分离到的X67706-Cox.B5病毒相对较远.表明此次脑膜脑炎的病因病毒与同是侵犯中枢神经系统的Cox.B5的原型株-AF114383-Cox.B5病毒亲缘关系最近,但核苷酸已经发生了＞18%的变异,可以认为其是Cox.B5新亚型病毒.