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进口白羽肉种鸡J亚群禽白血病病毒的全基因组序列分析

Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine(2019)

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摘要
为研究引起我国部分地区进口白羽肉种鸡发生禽白血病疫情的病毒来源及其变异趋势,本研究对从进口白羽肉种鸡分离的8株J亚群禽白血病病毒(ALV-J)的全基因组序列进行测序分析.8株ALV-J gp85氨基酸遗传演化分析显示,其与ALV-J肉鸡分离株(包括ALV-J原型病毒株HPRS-103、美国肉鸡ALV-J分离株、国内肉鸡分离株)及蛋鸡分离株氨基酸序列同源性均低于92.5%,而与国内2014年父母代白羽肉种鸡ALV-J分离株GD 14J2同源性较高,为93.5 %~95.1%,处于同一分支.8株ALV-J的3'非编码区(3'UTR)在rTM区缺失203 bp,DR-1区缺失7 bp,E元件位置缺失125 bp,仅保留了22个碱基,这一缺失特征与GD 14J2一致.8株ALV-J的3'LTR U3区序列与ALV-J肉鸡分离株及蛋鸡分离株的相应基因序列同源性均低于91.5%,而与GD 14J2病毒株的同源性较高,为94.3%~96.3%.序列分析发现U3区存在连续11 bp缺失和164位碱基突变(C/r),该突变形成2个新的转录调控元件AIB REP1、AIB REP2.综合gp85、3'UTR和U3区序列特征,推测引起本次进口白羽肉种鸡禽白血病的ALV-J与国内2014年父母代白羽肉种鸡ALV-J分离株GD14J2为同一来源.但本次分离到的ALV-J病毒株也有新的变异趋势,这些变异是否与ALV-J致病性相关,还需进一步研究.本研究为ALV-J有效防控和净化提供数据支持.
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