葡萄品种DNA指纹数据库的构建及遗传多样性分析

Journal of Plant Genetic Resources(2018)

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摘要
利用SSR分子标记技术对314份葡萄品种进行了DNA指纹数据库构建和遗传多样性分析,为葡萄品种鉴定、亲缘关系分析和植物品种权保护提供科学依据.结果表明:9对引物共扩增出199个等位基因,多态性位点为199个,多态性比率达100%,每个标记检测到的位点数在17 ~31之间,平均为22.1个;多态性信息含量(PIC)值变幅在0.793~0.886之间,平均值为0.839.本研究发现3组同名异物品种和9组疑似同物异名品种,除此之外的290份品种中,70份品种仅需1对引物即可区分开,其余品种需要引物组合来实现品种之间的区分.最少选用8对引物即可完全区分开290份葡萄品种.最终利用8对多态性SSR引物构建了314份供试材料的DNA指纹数据库,聚类分析结果表明:263份二倍体供试材料可被分为真葡萄亚属和圆叶葡萄亚属两大类,而真葡萄亚属又被分为15个亚类.51份多倍体供试材料被分为3组,聚类结果与供试材料已知的系谱来源基本吻合.
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关键词
genetic diversity,grape,DNA fingerprint database,SSR
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