基于PPI网络预测和验证结直肠癌相关Hub基因
Chinese Journal of Medical Library and Information Science（2019）
摘要
目的:通过PPI网络分析确定CRC相关Hub基因,为CRC靶向治疗提供一定参考.方法:从OpenTargets数据库获得CRC相关基因,使用Metascape对基因集进行富集分析,确定基因集富集术语.采用STRING数据库及CytoScape构建PPI网络,采用MCODE寻找PPI网络中的功能模块(子网).根据功能模块中节点的网络属性确定Hub基因,通过文献法和GEPIA数据库对Hub基因进行验证.结果:共得到CXCL8、ERBB2、CYCS 3个Hub基因,它们均与CRC的发生和发展有一定关系,.它们均在CRC组织与正常组织中存在差异表达,并与CRC患者的总体生存时间相关.结论:基于PPI的网络分析可准确预测CRC相关Hub基因和为CRC靶向治疗提供参考.
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