皮肤黑色素瘤免疫细胞浸润模式及其与预后的相关性分析

目的:研究皮肤黑色素瘤的免疫细胞浸润模式,以及免疫细胞浸润与患者预后的关系.方法:从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库下载皮肤黑色素瘤转录本数据及相关临床数据,使用Cibersort软件的反卷积法计算22种免疫细胞的占比,采用R编程语言计算免疫细胞占比与性别的相关性,采用K-M生存分析log-rank法计算每种免疫细胞占比与总生存期(overall survival,OS)的相关性.结果:从TCGA数据库中得到472例基因转录本数据,包含黑色素瘤组织470例,正常皮肤组织2例.每个样本检测基因位点60 483个,提取mRNA 19 658个.数据校正后使用Cibersort软件的反卷积法得到22种免疫细胞的占比数据,采用P＜0.05筛选样本,得到黑色素瘤组织219例,正常组织1例.M0巨噬细胞、CD8+T细胞、M2巨噬细胞在黑色素瘤中浸润水平较高;CD8+T细胞与M0巨噬细胞(-0.62)、未活化的记忆性CD4+T细胞与CD8+T细胞(-0.53)的占比相关性较强;K-M生存分析显示未活化的肥大细胞(P=0.015)、未活化的NK细胞(P=0.025)组成比例高者患者预后差,γδT细胞(P=0.043)组成比例高者预后更好.女性黑色素瘤患者中未活化的肥大细胞占比较男性黑色素瘤患者少(P=0.028).结论:皮肤黑色素瘤中浸润的免疫细胞组成存在差异,浸润的免疫细胞可能是决定预后的重要因素.这有助于开发有效的免疫疗法.