晚期糖基化终末产物刺激HASMCs细胞lncRNA差异表达的分析与鉴定

目的 通过基因芯片分析钙化条件下长链非编码RNA(lncRNA)的表达,并探究差异表达的lncRNA对血管平滑肌细胞发生钙化时的调控作用.方法 利用晚期糖基化终末产物(AGEs)构建人主动脉平滑肌细胞(HASMACs)钙化模型,最终确立AGEs最佳钙化干预浓度以作为接下来的实验依据.通过芯片技术获得AGEs作用下HASMACs的lncRNA差异表达谱,并对结果进行生物信息学分析.对差异mRNA进行GO分析包括生物学过程,细胞成分和分子功能等,并预测目的lncRNA及共表达蛋白.通过real-time PCR和Western Blot对预测的目的lncRNA及邻近功能相关蛋白的关系进行验证.结果 相对于对照组,实验组有954个差异表达的lncRNA,661个lncRNA表达上调,293个lncRNA表达降低,并且有741个mRNA表达上调,235个mRNA表达降低.lncRNA PACERR在AGEs作用的细胞中表达增高,功能学实验显示在体外沉默lncRNA PACERR表达后其功能相关蛋白PTGS2表达降低,同时减弱HASMACs的钙化.结论 钙化诱导下HASMACs的lncRNA存在明显的差异性表达,抑制目的lncRNA PACERR能够降低细胞钙化蛋白表达,提示PACERR可能通过调控PTGS2在HASMACs细胞钙化的发生发展中起重要作用.