云南横断山中部山区小型兽类感染巴贝虫的分子流行病学调查

为了解云南省横断山中部山区小型兽类感染巴贝虫的情况,分别于2013、2016和2020年在云南省横断山中部山区的剑川、云龙和洱源等3个县,采用笼日法和夹线法捕获小型兽类.通过形态学进行种类鉴定,并取脾组织、提取巴贝虫DNA,巢式PCR扩增巴贝虫18S rRNA基因片段,目的 条带经双向测序后,进行同源性分析,采用Neighbor-Joining法构建系统进化发育树.共捕获小型兽类498只,通过形态学鉴定,分属于4目8科14属27种,主要优势鼠种有齐氏姬鼠、中华姬鼠和大绒鼠,共有55份样品扩增出巴贝虫18S rRNA基因片段,总阳性率为11％ (55/498).剑川县、云龙县和洱源县的小型兽类巴贝虫阳性率分别为0.5％ (1/212)、31.6％(54/171)和0(0/115).巴贝虫阳性检出率比较高的小兽为:大耳姬鼠11/17,滇绒鼠5/10,印度长尾鼩鼱2/4.BLAST比对结果表明,本次检出的样品序列具有高度同源性,相似性达99.6％,属于田鼠巴贝虫的大津(Otsu)型.云南省横断山中部山区小型兽类存在巴贝虫感染,属于田鼠巴贝虫的Otsu型.