Infections Fongiques À Kazachstania Spp. : Une Levure Émergente ?

L’épidémiologie des infections fongiques invasives s’est modifiée au cours des dernières années. De rares agents pathogènes fongiques émergent et sont responsables d’infections invasives, notamment chez les patients immunodéprimés. L’objectif de cette étude était de décrire les infections à Kazachstania (Arxiozyma) spp, une levure appartenant à la famille des Saccharomycetaceae. Dans cette étude rétrospective observationnelle, nous avons inclus tous les patients ayant eu un prélèvement positif à Kazachstania spp. de 2007 à 2020, aux hôpitaux universitaires de Strasbourg. Nous avons classé les cas en infection fongique invasive selon les critères de l’EORTC/MSGRC, ou infection cutanéomuqueuse ou en colonisation. Toutes les souches ont été identifiées par spectrométrie de masse MALDI-TOF, et par séquençage de la région internal transcribed spacer (ITS) pour les souches responsables d’infections. La sensibilité aux différents antifongiques a été testée pour les souches responsables d’infections. Nous avons identifié 13 patients ayant eu un prélèvement positif à Kazachstania (Arxiozyma) spp. Parmi eux, 3 patients avaient à une infection fongique invasive, comprenant une médiastinite, une fongémie et une angiocholite et 1 patient avait une oesophagite, classée en infection cutanéomuqueuse. Les 9 derniers patients étaient colonisés. L’âge médian était de 63 ans et la majorité des patients avait au moins une comorbidité ayant pu favoriser l’infection ou la colonisation. Néanmoins, aucun patient avec une infection n’avait les critères d’hôte de l’EORTC/MSGRC. De façon intéressante, une pathologie oesophagienne était rapportée dans 4 cas sur 13 et 2 des patients ayant une infection invasive rapportaient une exposition aux pigeons. Toutes les souches ont initialement été identifiées par spectrométrie de masse MALDI-TOF comme Kazachstania telluris . Trois souches impliquées dans les cas d’infections ont finalement été identifiées par séquençage ITS comme Kazachstania bovina . Les antifongigrammes réalisés ( n = 6) montraient des CMI élevées (≥ 4) au fluconazole. Il s’agit de la première série de cas décrivant des infections fongiques à Kazachstania spp. Cette levure est impliquée dans des infections invasives, des infections cutanéomuqueuses et des colonisations. Nos données soulignent également l’intérêt du séquençage pour une identification correcte des espèces fongiques émergentes et montrent une sensibilité diminuée au fluconazole, antifongique de choix dans les infections à levures. Cliniciens et mycologues pourraient être de plus en plus confrontés à cette infection émergente du fait de l’augmentation du nombre de patients immunodéprimés et de l’amélioration des techniques diagnostiques.