抗生素对腹泻仔猪肠道微生物及四环素耐药基因的影响

本研究通过16S rDNA高通量测序分析技术及实时定量PCR等方法,结合统计学原理,分析抗生素治疗对腹泻仔猪肠道微生物及四环素耐药基因的影响.在同一栋猪舍同期出生的仔猪中,于10日龄左右随机选取体重3.2 kg左右且连续腹泻2 d以上的腹泻仔猪,采集其粪便样本作为腹泻组.按猪场常规治疗手段对腹泻仔猪用庆大霉素连续治疗3 d,采集治疗后仍腹泻仔猪的粪便样本作为抗生素治疗组.腹泻组与抗生素治疗组各随机选取6个样本进行检测分析.结果显示:与腹泻组相比,抗生素治疗组仔猪肠道菌群的多样性显著降低,拟杆菌属(Bacteroides)、萨特氏菌属(Sutterella)、Butyricimonas等菌属丰度显著升高,普氏菌属(Prevotella)、拟普雷沃菌属(Alloprevotella)、考拉杆菌属(Phascolarctobacterium)等丰度显著减少,tetC、tetG、tetO、tetQ基因丰度显著升高,且几种四环素耐药基因与菌群之间具有明显的相关性.综上可知,使用抗生素治疗腹泻会导致仔猪肠道菌群结构发生变化,并增加菌群的抗四环素基因的丰度.