岷江柏野生居群和迁地保护居群的遗传多样性比较

通过分析岷江柏的迁地保护居群和野生居群的遗传多样性、遗传结构及居群间基因流,判断迁地保护岷江柏居群的遗传多样性水平,为其迁地保护提供理论基础.本研究利用GBS(Genotyping-by-Sequencing)测序技术获得的SNP位点对四川大渡河双江口岷江柏迁地保护移栽苗、苗圃播种苗及3个野生居群进行主成分分析(PCA分析)、聚类分析、分子进化树、遗传多样性和遗传结构分析.经过GBS测序共获得高质量Clean Data 118321514728 bp,并开发了1947047个tags,从中鉴定到了1259610个SNP位点.系统发育进化树显示大部分移栽岷江柏居群和野生岷江柏聚在一起,居群结构分析结果显示交叉验证错误率的谷值确定最优分群数为1.4个岷江柏居群的观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、Shannon信息指数I(Shi)、近交系数(Fis)、多态信息含量(Pic)的值分别为0.1815～0.2720、0.2232～0.3003、0.3310～0.4649、0.1780～0.2465和0.2722～0.3092,说明岷江柏居群的遗传多样性水平较高.移栽岷江柏居群的He=0.3003,Shi=0.4649,岷江柏居群迁地保护居群遗传多样性总体水平略高于野生居群.野生岷江柏居群中白湾隧道(BW)_vs_松岗镇(SA)的遗传分化指数(Fst)较大,基因流(Nm)较小(Fst=0.091,Nm=2.496),而迁地保护的岷江柏居群与野生岷江柏居群没有明显的遗传分化,居群间的基因交流频繁(Fst<0.05,基因流Nm>4),说明没有明显的分群现象,岷江柏居群迁地保护居群遗传多样性较高.因此,移栽濒危植物是迁地保护过程中较好的方法,本文为以后野生岷江柏迁地保护提供参考,为其他树木种质资源的保存提供理论依据.