薄壳山核桃(Carya illinoinensis)叶绿体基因组及其特征分析
Acta Horticulturae Sinica（2022）
摘要
利用Illumina平台对薄壳山核桃(Carya illinoinensis)品种'金华''波尼'和1株实生古树单株的叶绿体全基因组进行测序,并对其特征进行分析.3个薄壳山核桃叶绿体基因组均呈典型的四分体结构,大小分别为160 819、162 611和160 762 bp,基因序列高度保守.三者均注释得到124个基因,包括79种蛋白编码基因、38个tRNA和7个rRNA基因;三者有相似的重复序列类型,在其叶绿体基因组序列中分别检测出74、74和73个SSR位点;系统发育分析表明,三者均与喙核桃(Annamocarya sinensis)亲缘关系最为密切.
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