广州市柯萨奇病毒A10型VP1区基因特征分析

目的 了解广州市手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病例中柯萨奇病毒A1(型(coxsackievirus A10,CV-A10)VP1区基因特征.方法 采用荧光RT-PCR法对2017-2020年广州市HFMD病例标本进行检测确定病毒型别.对CV-A10阳性病例流行病学特点进行分析.挑选CV-A10阳性代表样本进行病毒培养和VP1区基因扩增测序,采用DNAstar7.1及Mega 6.0对测序序列进行分析.结果2017-2020年共检测肠道病毒阳性样本8430份,其中CV-A10阳性样本564份(6.69％).CV-A10阳性病例主要集中在5-7月,以5岁以下儿童为主,男女性别比为1.42:1.本研究共获得68株CV-A10毒株VP1区全长序列,对其进行序列分析表明,CV-A10毒株之间核苷酸和氨基酸同源性分别为90.8％～100％和96.9％～100％,与原型株Kowalik(AF081300)核苷酸和氨基酸同源性为69.8％～71.8％和91.4％～93.8％.分子进化树分析显示,广州市CV-A10毒株均位于C2亚型中的Cluster1和Cluster3 2个分支上.结论 CV-A10是引起广州市HFMD的优势病原体之一,其基因型均为C2亚型,2017-2020年共有2个分支在广州市共同流行.