虾源达卡气单胞菌全基因组分析和致病性研究

目的 为了解虾源达卡气单胞菌的毒力、耐药基因分布和全基因组信息,并初步评估达卡气单胞菌的致病性.方法 对虾源分离株进行分子鉴定和多位点序列分型;利用β-溶血和胞外蛋白酶实验、秀丽隐杆线虫液体毒性实验、细胞毒实验、小鼠实验及毒力基因检测研究其致病性;通过药敏实验及耐药基因检测分析其耐药特征;利用eggnog、Prophage Hunter工具对全基因组序列进行分析.结果 菌株18FX22鉴定为达卡气单胞菌.该菌的致病性主要表现:有β-溶血能力和胞外蛋白酶活性;对秀丽隐杆线虫、小鼠成纤维细胞和小鼠均有致病性.经检测,该菌携带7种毒力基因和12种耐药基因,发现其对阿莫西林/克拉维酸、头孢唑林和多粘菌素3种药物有耐药性.全基因组测序结果发现:18FX22的全基因组大小为4 811 079 bp,GC含量为61.33％.COG注释发现18FX22共有3850个基因,具有20类功能.前噬菌体预测结果发现18FX22的基因组中含有2个前噬菌体序列.全球达卡气单胞菌的聚类结果显示该菌与GCA016729585的进化关系更近.结论 本研究从商品虾分离出达卡气单胞菌,发现该菌株的毒性较强,指示应加强海鲜食品安全的管控,并为达卡气单胞菌的防治提供参考.