一种模拟游离DNA阳性质控品的制备方法及表征

Acta Metrologica Sinica(2023)

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摘要
通过优化一种新型的机理未明确的类酶解作用体系(reaction system,RS),直接作用带有KRAS G12C,KRAS G12D,EGFR L858R 和 EGFR T790M 突变的肿瘤细胞系 SW1573,SNU-C2B 和 NCI-H1975,通过对 RS 体系作用时间及作用的细胞数量的优化,可以裂解细胞基因组DNA制备得到一种可以高度模拟人体血浆游离DNA(cfDNA)阳性质控品.经芯片电泳检测获得的模拟cfDNA片段长度集中于(166±16)BP,与正常人体血浆cfDNA大小一致;通过微滴数字PCR检测显示RS制备的DNA片段和gDNA在目标突变位点处具有一致的突变丰度.表明经RS体系制备得到的DNA片段可以作为一种cfDNA的阳性质控品.
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