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基于生物信息学及分子对接探讨胃食管反流病和肠易激综合征重叠症发病机制及中药组方预测

Hunan Journal of Traditional Chinese Medicine(2023)

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摘要
目的:探讨胃食管反流病(GERD)和肠易激综合征(IBS)重叠症的中医病机及病理机制,为中药组方提供理论引鉴.方法:通过DisGeNET数据库和人类基因注释数据库及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析筛选出与IBS和GERD共同相关的关键靶点,并对其进行基因本体(GO)功能与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.根据口服生物利用度≥30%、类药性≥0.18、度值筛选出与靶点相关的候选化合物,对度值排名前3位的靶点与每一种候选化合物两两之间计算分子结合能以验证可靠性.通过TCMSP寻找与候选化合物相关的中药,并筛选出度值≥4的中药做靶点-化合物-中药网络,对所筛选出的中药进行药性、归经、功效频数分析.结果:共获得60个关键靶点,GO功能分析显示其与20个生物过程,13个细胞成分,15个分子功能有关;其中有28个关键靶点可被匹配,共收集到50个候选化合物,度值≥4的中药有71味;共制作150对分子对接,结果显示,靶点与化合物间结合活性较强,预测准确性较高;中药频数统计结果显示,可作用到疾病靶点的中药药性多为寒性,药味多苦、甘,多归肝、肺经,功效种类以清热、补虚为主.结论:本实验通过生物信息学手段和药物规律分析为GERD和IBS重叠症的中医病机理论和中药组方治疗引入了现代分子实验层面的数据支持,为中医现代病机及组方理论研究提供了新的切入点.
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