白鸡冠茶树品种叶色白化相关共表达网络构建及潜在核心基因发掘

白鸡冠茶树是光照敏感型茶树,为挖掘与白鸡冠茶树在光照和遮阴条件下叶色变化相关的关键基因,选取遮阴和恢复光照处理白鸡冠第二叶5个时期的转录组数据,通过加权网络共表达分析(WGCNA)方法构建模块.6 580个差异表达基因构建的WGCNA网络被分为15个模块,其中darkseagreen模块与叶绿素含量相对值(SPAD值)显著正相关,honeydew模块和SPAD值显著负相关.GO富集结果表明darkseagreen模块显著富集到初级代谢过程的调节和压力响应等过程,而honeydew模块在叶绿体和单器官代谢等过程显著富集.从darkseagreen模块和honeydew模块中发掘到数个潜在核心基因,并采用Cytoscape对darkseagreen模块和honeydew模块的基因绘制互作网络图,进而从darkseagreen模块筛选出2个基因(CSS0019351.CSS0045917)和2个转录因子(CSS0046793和CSS0018417),在honeydew模块筛选出2个基因(CSS0031492和CSS0036305)和1个转录因子(CSS0023211).本研究通过WGCNA方法筛选出2个具有生物学意义的模块,进一步挖掘得到的7个关键基因和转录因子与叶绿素合成和叶绿体发育密切相关.