细粒棘球绦虫泛素结合酶基因家族的生物信息学及表达分析

本研究对细粒棘球绦虫泛素结合酶(EgE2s)基因家族进行鉴定、生物信息学分析以及检测其在不同发育阶段的转录水平,为其功能研究和构建优势抗原表位疫苗奠定基础.本研究基于数据库中细粒棘球绦虫基因组学信息,对EgE2s基因家族进行T-A克隆、生物信息学分析以及采用qRT-PCR法检测了这些基因在原头蚴(Proto-scolex,PSCs)和28日龄童虫中的转录水平.结果成功克隆并测序19个EgE2s基因,更正了两个原序列有误的EgE2s,分别为EgE2L3(登录号:MZ277618);EgE2J1(登录号:MZ277619).三级结构和保守基序预测结果表明EgE2s高度保守.qRT-PCR结果显示,EgE2s的转录水平在PSCs和28日龄童虫中存在差异,其中EgE2A(P＜0.001)、EgE2J1(P＜0.01)在PSCs阶段高表达.B细胞抗原表位预测表明EgE2N的139-157区域位于EgE2s保守基序外.同时,T细胞抗原表位预测表明EgE2N与人和犬MHC Ⅱ类分子各有两个强结合位点,且有一个共同的抗原表位位点104-113.综上,EgE2A和EgE2J1可能在PSCs的生长发育中起重要作用.EgE2N的139-157和104-113区域可能是药物研究和疫苗开发的靶序列.