大豆咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶(CCoAOMT)基因克隆及结构分析

[目的]对大豆中咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶(CCoAOMT)基因进行克隆和生物信息学分析,为研究木质素代谢途径关键基因 CCoAOMT在大豆抗胞囊线虫的作用机制奠定基础.[方法]以高抗大豆胞囊线虫(Heterodera glycines Ichinohe)3号生理小种品种灰皮支黑豆根系为材料,利用RT-PCR技术进行克隆.[结果]克隆得到 1条大豆 CCoAOMT基因的cDNA全长序列,将其命名为 GmCCoAOMT,GenBank登录号为MW480860.该基因全长为 848 bp,含有 1个 741 bp的开放阅读框,编码 246个氨基酸组成的蛋白,分子量为 27.6 kDa,等电点为5.67;亚细胞定位预测显示,CCoAOMT蛋白可能位于细胞质,该蛋白含有 1个保守的AdoMet_MTases结构域,属于AdoMet_MTases超级家族;在与其他豆科植物CCoAOMT编码的蛋白序列比对及系统进化树分析中,GmCCoAOMT编码的蛋白序列与其他豆科植物具有较高的相似性.[结论]获得大豆CCoAOMT基因的cDNA全长序列,通过构建进化树确定大豆与豇豆、木豆、菜豆和赤豆的CCoAOMT蛋白进化关系较近,而与白羽扇豆和鹰嘴豆进化关系较远.