短短芽胞杆菌B011基因组中芽胞形成调控基因spo0E的鉴定与表达分析
Chinese Journal of Biological Control（2023）
摘要
短短芽胞杆菌 B011 是一株具有广谱抗菌活性的植物内生菌,发酵后期形成芽胞.据报道,芽胞形成调控基因Spo0E的编码产物能对Spo0A～P蛋白因子去磷酸化,从而实现芽胞形成的负调控.为了能够进一步验证B011基因组中Spo0E基因的功能和表达情况,为B011菌株的遗传改造提供候选基因,本研究基于B011 全基因组序列,通过生物信息学工具预测得到了 9 个spo0E类似基因,并与其他已公布全基因组序列的 101 个短芽胞杆菌Brevibacillus菌株进行比较,结果表明短短芽胞杆菌spo0E家族基因在物种分化前就已经存在.转录组测序结果表明,FO446_19435 和FO446_04050两个spo0E家族基因在B011中高表达,表达模式表现为先升高,在发酵 18 h达到最高,此后下降,这两个基因均存在SQELD基序,推测这两个基因为B011中的两个主效spo0E基因.研究结果可为短短芽胞杆菌B011的进一步开发和利用提供一定的基础.
更多关键词
Brevibacillus brevis,endospore,whole genome sequences,spo0E gene
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