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西班牙在去年3月废水样本中检出新冠病毒,这个研究靠谱吗?

作者: 科研大匠

时间: 2020-06-28 12:11

西班牙在去年3月废水样本中检出新冠病毒,这个研究靠谱吗?

6月26日,西班牙巴塞罗那大学发布公告称,该校领导的一个研究小组在2019年3月采集的巴塞罗那废水样本中检测出新冠病毒。

这项新研究结果挑战了目前关于新冠病毒起源和时间的共识。公告出来后,在业内引起了巨大争议,也吸引了世界各大媒体的广泛关注。

公告称,巴塞罗那大学肠道病毒小组的研究人员对当地废水样本做了检测,结果发现在2019年3月12日采集的废水中已有新冠病毒的踪迹,此前该小组的研究人员已在2020年1月15日的废水样本中检测到了新冠病毒的存在。而西班牙本土直到今年2月25日才报告首例新冠确诊病例。

巴塞罗那大学公告的这项研究,由该校生物学教授 Albert Bosch 领导,该研究结果已经于6月13日发表在未经同行评审的预印本网站 medRxiv上。研究题为“Sentinel surveillance of SARS-CoV-2 in wastewater anticipates the occurrence of COVID-19 cases

Albert Bosch 教授称 研究小组检查了2018和2019年的废水样本,目前仅有2019年3月12日的样本聚合酶链式反应(PCR)检测呈阳性,且病毒水平非常低,其他所有样本的检测结果均为阴性。他认为,巴塞罗那旅游业发达,游客众多,这一研究结果表明世界其他地区很可能也发生了类似情况,但许多病例或因被误诊为流感病例而被掩盖。

为分析西班牙 SARS-CoV-2 的存在情况,研究人员对巴塞罗那的两个大型污水处理厂( WWTP1 和 WWTP2 )的 24 小时复合污水样本进行了检测分析。在分析WWTP2 2019 年 12 月至 2020 年 5 月的时间段样本发现了一个出乎意料的结果,分析表明:在 2020 年 1 月 15 日至 3 月 4 日样本中,新冠病毒的基因组就在不断增加,更值得注意的是,巴塞罗那宣布第一例新冠病例( 2 月 25 日)前 41 天( 1 月 15 日)在污水中就能检测到新冠病毒了,研究者认为,这证明废水监测能够有效地预测新冠病例的人口规模。

具体检测方法:通过用 20% 聚乙二醇 6000 沉淀将 800 毫升废水样品浓缩,并重悬于 3 毫升 pH 7.4 的 PBS 中, 从 1 毫升浓缩物中进行核酸提取,并使用提取系统以 50 微升洗脱。研究方案采取实时 RT-PCR 检测新冠病毒。

对于废水监测预测新冠病例的人口规模,Nature曾发文梳理:

于是,研究组冰冻保存的WWTP2 样本进行了检测,在对 WWTP2  2018 年( 1 月至 3 月)、2019 年( 1 月、3 月、9 月至 12 月)和 2020 年( 1 月至 3 月)的冷冻污水样品进行检测分析后,有了惊人发现:

检测结果显示,在 2019 年 3 月 12 日的样本中, IP2 和 IP4 靶点检测均呈阳性。

不过,对于该研究,有专业人士评论称:该研究样本污染机会比较多。研究中使用800克的污水加聚乙二醇6000获得沉淀,然后溶解为3毫升。浓缩步骤不规范。用的是制备技术,而不是微量分析技术的样品浓缩方法。应该用膜吸附的方法浓缩,这里的层析膜是经过验证的,没有任何污染,而且很容易做好空白对照实验。

多位专家也指出:研究人员应该公布测得的基因序列,这样才可以比对出病毒演化位置。

还有人提出一个疑点:为何仅在2019年3月12日的样本中检测到弱阳性,3月份以后都消失了?

现在下结论还为时过早,有可能是假阳性。”

对于该研究,西班牙公共卫生局Joan Ramon Villalbi博士表示:

“目前只看到一个结果,我们需要参照更多的数据、研究和样本来证实它,并排除实验室错误或方法漏洞问题。”

参考信息:

1. https://www.ub.edu/web/ub/ca/menu_eines/noticies/2020/06/04html

2. https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.06.13.20129627v1.article-info

版权声明:本文由科研大匠编译自巴塞罗那大学、nature、medrxiv等,仅用于学术分享

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