Из почвы и пищеварительных трактов почвенных и навозных дождевых червей изолированы и идентифицированы несколько сотен штаммов бактерий, принадлежащих к разным таксонам, а также охарактеризованы некоторые их физиолого-биохимические свойства. Установлено, что большинство штаммов кишечных бактерий червей является факультативными анаэробами. Кишечные изоляты бактерий обладали повышенной, по сравнению с почвенными, активностью протеаз и дегидрогеназ. Кроме того, бактерии, ассоциированные с кишечниками червей, способны к росту на гуминовой кислоте как на единственном источнике углерода; при этом гуминовая кислота стимулировала рост кишечных бактерий больше, чем почвенных, а в самих пищеварительных трактах обнаружена полифенолоксидазная активность. В совокупности с данными о таксономической обособленности кишечных бактерий, описанные признаки свидетельствуют о наличии в кишечнике червей группы бактерий, которая функционально характерна для кишечника червей и отличается от почвенных бактерий.