基于网络药理学和分子对接的藏药"甘松-余甘子"治疗幽门螺杆菌相关胃炎的机制探究

目的 文章基于网络药理学和分子对接的方法,探究藏药"甘松-余甘子"治疗幽门螺杆菌相关胃炎的相关作用机制.方法 运用TCMSP,获得藏药"甘松-余甘子"活性成分及相关的作用靶点,应用GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库获得幽门螺杆菌相关胃炎相关靶点,绘制韦恩图获取药物疾病共同靶点,将其输入Cytoscape 3.7.2软件绘制"药物-成分-疾病-靶点"网络.运用R语言及Cytoscape 3.7.2软件构建蛋白相互作用PPI网络.通过R语言对靶点基因进行GO、KEGG集分析.分别采用AutoDock软件、Pymol软件进行分子对接、可视化验证.结果 藏药"甘松-余甘子"通过15个有效成分作用于16个幽门螺杆菌相关胃炎治疗靶点.筛选出4种核心有效成分,4个核心靶点包括PTGS2、TNF、CASP3、TP53.GO富集分析主要涉及神经元死亡调节、神经元死亡、电离辐射响应、糖皮质激素反应、对紫外线的反应、内在的凋亡信号通路、皮质类固醇反应等生物过程进行调节,KEGG富集分析主要涉及P53信号通路、HIF-1信号通路、TNF信号通路.4种核心有效成分与主要核心靶点PTGS2、TNF、CASP3、TP53均具有一定的结合活性.结论 藏药"甘松-余甘子"治疗幽门螺杆菌相关胃炎的机制,可能是通过"多成分-多靶点-多通路",发挥抗炎、抗癌、抗氧化、抗凋亡、促进血管生成的作用.