Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук
被引用0|浏览0
摘要
Ренин-ангиотензин-альдостероновая система (РААС) играет ключевую роль в гормональной регуляции артери- ального давления. В этой работе исследованы эволюционные характеристики ассоциативной генной сети РААС человека, ра- нее реконструированной нами с использованием информационно-программного пакета ANDSystem и содержащей 145 генов. Для каждого из этих генов с помощью созданного нами веб-сервиса OrthoWeb были вычислены две эволюционные характери- стики: индекс PAI (phylogenetic age index – оценка эволюционного возраста гена) и индекс DI (divergence index – оценка режима эволюции гена). PAI соответствует возрасту узла филогенетического древа, в котором возникла эволюционная ветвь, ведущая к рассматриваемому гену. DI равен среднеарифметической оценке отношения числа несинонимичных замен dN к числу сино- нимичных замен dS (dN/dS) в белок-кодирующей области изучаемого гена. На основе оценок PAI с уровнем значимости p < 0.05 в сравнении со всеми белок-кодирующими генами человека было показано достоверно большое количество, 59 из 145, генов РААС (41 %), эволюционный возраст которых соответствовал формированию таксона многоклеточных организмов (Metazoa) до появления кровеносной системы. На основе оценок DI с уровнем значимости p < 0.05 в таксоне Hominidae показано, что 89 генов РААС эволюционировали в режиме стабилизирующего отбора, 54 гена – в режиме нейтрального дрейфа, а два гена, EDN1 и PLA2G2A, – в режиме движущего отбора (адаптивной эволюции).
更多
查看译文
关键词
ренин-ангиотензин-альдостероновая система (раас),волюционная генетика,биоинформатика,филостра- тиграфический анализ,эндотелин,фосфолипаза,естественный отбор,нейтральный дрейф,индекс эволюционного возраста гена,индекс дивергенции