微阵列数据癌症分类问题中的基因选择
Journal of Computer Research and Development(2009)
摘要
微阵列数据广泛而成功地应用于生物医学的癌症分类研究.一个典型的微阵列数据集包含大量(通常成千上万,甚至数十万)的基因、相对少量(往往不足一百)的样本.在这成千上万的基因中,仅仅一少部分基因对癌症分类有贡献.因而,对于癌症分类来说,最重要的一个问题就是识别出对癌症分类最有贡献的基因.这一识别过程称为基因选择.基因选择在统计模式识别、机器学习和数据挖掘领域已得到广泛研究.介绍基因选择问题所涉及到的相关背景知识和基本概念;全面地回顾统计学、机器学习和数据挖掘领域对基因选择问题的解决方法;通过实验展示了几种典型算法在微阵列数据上的性能;指出当前存在的问题和未来的研究方向.
更多关键词
Microarray,Feature Selection,Genomic Data Integration,Gene Set Enrichment Analysis,Computational Biology