利用SLAF-seq简化基因组测序技术对驴基因组进行测序分析
肖海霞, 阿布来提·苏来曼, 托乎提·阿及德, 努尔尼萨·莫拉尼亚孜, 帕热哈提江·吾甫尔,王琼,张国庭,谢立荣,苏玲玲,田可川,刘武军 Animal industry and environment(2021)
摘要
本文利用SLAF-seq简化基因组测序技术,通过选择驴基因组预测电子酶切组合方式,最终使用RsaI+EcoRV-HF?进行酶切,酶切效率为95.24%,将长度为364~394bp的测序序列定义为一个SLAF标签,预测了到234762个SLAF标签.通过生物信息学分析获得SLAF标签数为1,416,014个SLAF标签数(900,598个多态性SLAF标签),获得的群体SNP为4,887,196个,为与疆岳驴乳用性状做全基因组关联分析奠定了基础.
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