Étude du profil moléculaire des gliomes par CGH array sur puce pangénomique à ADN

Objectifs. — Evaluer la technique de CGH-array pour caracteriser le profil moleculaire des tumeurs gliales Materiels et methodes. — L’ADN provenant de 94 tumeurs gliales a ete etudiee par CGH-array sur une puce pangenomique a haute resolution (4 000 clones). Les profils moleculaires furent ensuite analyses de maniere supervisee et non supervisee a l’aide d’un logiciel de clustering. Les tumeurs furent en parallele caracterisees sur le plan moleculaire par des techniques conventionnelles (allelotypage, PCR quantitative) Resultats. — La CGH-array permet de detecter en une seule fois, avec une plus grande fiabilite et precision les desequilibres genomiques que les techniques de biologie moleculaire classiques (allelotypage, CGH classique, PCR Q) en particulier les deletions chromosomiques connues (perte des chromosomes 1p, 9p, 10q, 19q), les amplifications geniques (EGFR, PDGFRA), les gains chromosomiques (chromosome 7), mais de plus repere des alterations recurrentes moins bien connues (perte du chromosome 4, gain du chromosome 19). En outre, sa haute resolution permet d’affiner considerablement les cartographies de deletions et de resserrer les regions candidates en particulier sur le 1p en detectant des micro-deletions tres informatives qui seraient passees inapercues en allelotypage ou CGH classique. Enfin, elle permet d’analyser une alteration donnee dans son environnement moleculaire general. Ainsi l’analyse par « clustering » permet de classer les tumeurs en fonction de profils d’alterations homogenes dont la pertinence peut etre validee dans un second temps en les confrontant avec les donnees evolutives et histologiques des patients. Conclusion. — La CGH-array sur puce pangenomique est une technique fiable pour caracteriser le profil moleculaire des tumeurs et contribuer a une nouvelle classification histo-pronostique des gliomes.