奥利亚罗非鱼微卫星位点的筛选

从GenBank上选取40对尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)的微卫星引物, 分别在奥利亚罗非鱼(Oreochromis aureus)(83系)、红色奥利亚罗非鱼、奥利亚罗非鱼(02系)和尼罗罗非鱼的基因组上进行扩增.40对引物中有37对(92.5%)可进行有效扩增, 32对引物(80%)可检测到个体间等位基因的多态性.其中引物UNH168与奥利亚罗非鱼的性别相关,在雌性个体中可扩增出二条大小不同的特异带(分别为135和171 bp),在雄性个体中则只有一条(171 bp).将特异条带回收、克隆并测序,结果显示雌雄个体中171 bp条带的序列完全相同,包括103 bp的侧翼序列和34个CA重复, 在雌性个体中获得的135 bp条带则只有16个CA重复.引物UNH846、UNH860和UNH995可鉴别奥利亚罗非鱼和尼罗罗非鱼,UNH890可鉴别出红色奥利亚罗非鱼.可见,大部分的尼罗罗非鱼微卫星位点存在于奥利亚罗非鱼中.