动态监测婴儿肠道16S rDNA宏基因组5例报告

目的：探讨婴儿肠道16S rDNA宏基因组的动态变化。方法收集5例健康婴儿生后3 d、1个月、6个月、1岁时粪便样本共17份，提取细菌总DNA，采用新一代高通量测序技术对16S rDNA的V6高变区测序并进行物种分类、丰度及多样性分析。结果17份样品共产生原始测序数据为2190.66 Mbp，Operational Taxonomic Units（OTU）数量36~308；优势菌门包括变形菌门、厚壁菌门、拟杆菌门和放线菌门；不同婴儿间肠道菌群分布有差异；科水平>1%的物种生后3 d时2~4种，1个月、6个月时增至最多7种，1岁时达10种；4个时间点的npShannon和Simpson指数均值分别为1.117、1.460、2.088、2.50和0.443、0.408、0.229、0.143。结论婴儿粪便中含丰富细菌基因组；细菌物种丰度及分类存在个体差异；细菌多样性随日龄而增加，婴儿肠道菌群结构出生后逐渐趋向复杂和多样。