胃癌下调全长基因GDDR的克隆及与胃癌关系的研究

目的从成功建立的用于筛选胃癌下调新基因的抑制消减杂交cDNA文库中克隆全长新基因;检测其在胃癌及正常胃黏膜组织中的表达,分析其在胃癌发生发展中的作用.方法随机挑选阳性克隆测序筛选基因片段,cDNA末端快速扩增得到其全长.在25例胃癌与正常胃黏膜RNA进行半定量RT-PCR.生物信息分析基因结构、染色体定位,并行其推导蛋白性质与功能的研究.结果筛选到一331 bp的基因片段, 经cDNA末端快速扩增,得到了长度750 bp 的全长新基因.命名为GDDR, 被国际GenBank收录,收录号:AF494509.RT-PCR表明它在胃癌中明显下调(GDDR/β-肌动蛋白13.5±5.1与1.04±0.20, P<0.01).染色体定位2p13, 由5个外显子组成.与CA11在染色体上的距离仅差22k bp,即均位于2p13.其编码蛋白前有一跨膜肽区, 与胃癌候选抑癌基因CA11编码蛋白为同源蛋白,均为新的BRICHO家族成员.结论得到一胃癌下调全长新基因GDDR,它可能为BRICHO家族中又一胃癌相关基因.