细胞学标本间变性淋巴瘤激酶蛋白表达及基因融合检测规范化流程

目的：研究细胞学标本间变性淋巴瘤激酶（ ALK）蛋白表达及基因融合检测的规范化流程。方法收集北京市7所三级甲等医院晚期肺腺癌细胞学标本，按照设计的规范化流程检测ALK蛋白表达及基因融合状态。制作福尔马林固定石蜡包埋（ FFPE）细胞学蜡块，应用免疫组化（ IHC）方法鉴别肿瘤细胞的来源与分型；应用Ventana IHC ALK（ D5F3）检测ALK蛋白的表达；应用实时荧光定量PCR（ qRT?PCR）方法检测表皮生长因子受体（ EGFR）基因野生型标本中ALK基因融合，并对无法制作细胞学蜡块的细胞学标本进行ALK基因融合检测；Ventana IHC ALK（ D5F3）检测阳性标本应用荧光原位杂交（FISH）方法验证ALK基因的融合状态。分析Ventana IHC ALK（D5F3）检测阳性并采用克唑替尼治疗患者的疗效。结果229例细胞学标本符合肺腺癌诊断，其中207例标本采用至少1种方法检测并获得ALK蛋白表达和基因融合检测结果，检测率为90．4％（207／229）。203例标本成功制作FFPE细胞学蜡块，应用Ventana IHC ALK（D5F3）检测ALK蛋白表达的成功率为100．0％，阳性率为10．3％（21／203）。98例EGFR基因野生型肺腺癌FFPE细胞学标本采用qRT?PCR方法检测ALK基因融合，96例检测成功（97．96％）。以qRT?PCR方法为标准，Ventana IHC ALK（D5F3）检测ALK蛋白表达的灵敏度为100．0％，特异性为98．7％。2种检测方法一致率为94．7％（ Kappa＝0．967， P＜0．001）。 FISH方法对Ventana IHC ALK（ D5F3）表达阳性的结果进行验证，2例寡肿瘤细胞学标本无法获得明确判读结果。6例Ventana IHC ALK（ D5F3）检测ALK蛋白表达阳性的患者选用克唑替尼治疗，有效5例。2例细胞学蜡块应用4％甲醛固定72 h后，Ventana IHC ALK（ D5F3）染色强度明显减弱；10例患者分别用FFPE细胞学蜡块标本切片和刮取细胞学甩片中细胞提取总RNA，qRT?PCR检测ALK基因融合结果一致。结论所设计的ALK蛋白表达及基因融合检测流程，扩展了细胞学标本的检测类型，提高了检测率。 Ventana IHC ALK（ D5F3）是检测细胞学标本ALK蛋白表达的可靠方法，检测前病理质量控制过程对检测结果的准确性至关重要。细胞学标本无法制作细胞学蜡块时， qRT?PCR是进行ALK基因融合检测的可选方法。